بستر کشت در کشت های گلخانه ای محل استقرار و تامین آب و مواد غذایی گیاهان می­باشد. علاوه بر این موارد اکسیژن مورد نیاز گیاه توسط خلل و فرج خاک به گیاه می­رسد. هرچه محیط رشد گیاه قابل کنترل­تر باشد، محصول با کیفیت تری می­توان تولید نمود. امروزه برای کنترل  تغذیه گیاهان از سیستم­های هیدروپونیک استفاده می­شود. سیستم­های هیدروپونیک تغذیه گیاهان را در مراحل مختلف رشد با توجه به برنامه­های غذایی که توسط کارشناسان تغذیه گیاهی با توجه به نوع کشت و مرحله رشدی تعیین می شود، انجام می­دهند.

مواد مختلفی به منظور بستر کشت هیدروپونیک، در گلخانه استفاده می شود که در اینجا به چند مورد مهم آن اشاره می کنیم.

در گلخانه­ های کشت هیدروپونیک بیشتر از ترکیب کوکوپیت با پرلیت و یا بسترهای آماده کشت کیسه­ای استفاده می­شود.به طور کلی استفاده از ترکیبات مختلف در بستر های کشت به فاکتورهای مختلفی بستگی دارد که مهترین آن قیمتو دردسترس بود مواد اولیه می باشد.

از مزایای کشت هیدروپونیک می توان به موارد زیر اشاره کرد :

به طور خلاصه در این روش گیاهان با توجه به حجم مورد نیاز ریشه در داخل گلدان مخصوص قرار می­گیرد. در این روش می­توان گلدان را روی زمین یا بسترهای مخصوص گلدان در ارتفاعی مناسب با کشت قرار داد. آب و مواد غذایی توسط قطره چکان­هایی که برای هر گلدان تعبیه شده است در اختیار گیاه قرار ­می­گیرد.

به طور کلی بسترهای کشت هیدروپونیک به شکل­های مختلفی اجرا می­شود. اولین و راحت ترین روش کاشت در سطح کف گلخانه می­باشد. در این حالت با ایجاد بستر کشت مناسب در کف گلخانه ردیف­های کشت را روی سطح زمین می توان کاشت. برای زهکش کف گلخانه می­توان از شن و ماسه و یا لیکا استفاده کرد. بسترهای کشتی که در ارتفاع و فاصله معین از زمین کار می­شوند مناسب تر می باشند. سکوی این نوع بسترها با استفاده از بتن، آلومینیوم، آهن، جعبه­های پلاستیکی، کارتن پلاست، بسترهای آماده فایبرگلاس و یا کائوچویی ساخته می شوند. برای استفاده از بستر با کارتن پلاست می­توان با ساخت سازه فلزی مخصوص بستر بادوام، عمر مفید کارتن پلاست را بالا برد و بسترهای مرتب و یکپارچه بهتری داشت

در این مدل از کشت، گیاه در بستر­های کیسه ای مخصوص کشت می شود. این کیسه­های کشت تجاری را می توان در روی زمین و یا بسته به نوع کشت در روی بستر فلزی یا ارتفاع مورد نیاز بر روی پایه­های مخصوص قرار داد. این بستر آماده موجب افزایش سرعت کار می شود. کاهش نیروی انسانی جهت آماده سازی در گروبگ بسیار قابل توجه است. به طور کلی گروبگ ها در کشت صیفی جات کاربرد فراوانی دارد

برای کشت گلخانه­های هیدروپونیک، در دسترس قرار دادن عناصر میکرو و ماکرو مطابق کشت و برنامه اصولی و دقیق انجام شود. از آنجا که تغذیه گیاهان با دست ممکن است با خطاهایی مواجه شود، استفاده از دستگاه تغذیه گلخانه­های هیدروپونیک امری اجتناب ناپذیر و حیاتی است. این دستگاه فرمول تغذیه قابل برنامه ریزی و دقیقی دارد و مدیریت کشت را آسان می کند.

در هر منطقه ای آب­ با درجه شوری و سختی متفاوتی وجود دارد. از آنجا که در تولیدات محصولات کشاورزی و گلخانه­ای نیاز به آب با درصد­های شوری و سختی مشخصی است، استفاده از دستگاه آب شیرین کن هزینه اولیه بالایی دارد ولی با کاشت و برداشت محصول با کیفیت­تر می­توان هزینه آن را به سیستم کاری بازگشت داد. در دستگاه­های تصفیه آب کشاورزی می­توان مانند دستگاه­های صنعتی از روش اسمز معکوس استفاده کرد. در این روش با استفاده از افزودن مواد می­توان سختی آب و در نهایت کیفیت آب را تغییر داد و به مقدار مورد نیاز رسانید.

اجزای تشکیل دهنده آب شیرین کن یا دستگاه تصفیه آب کشاورزی عبارتند از:

آب شیرین کن برای افزایش تولید محصولات کشاورزی و کیفیت آن و جلوگیری از، از بین رفتن کیفیت خاک زمین و کاهش شوری آب مورد استفاده که موجب گرفتگی نوارهای آبرسانی و قطره چکان­ها به خصوص در کشت­های گلخانه­ای می شود مورد استفاده قرار می گیرد.